复合土工膜的铺设分为平铺和斜铺。铺设渠道复合土工膜前，应根据设计渠道底部的要求，将渠道土方挖到设计高度，机械压实后方可铺设。如果渠道内的水坑清除积水，清除淤泥回填土或砾石，按要求夯实或压实后方可铺设。复合土工膜的平铺应具有3%的余量。

铺设复合土工膜时，连接应顺水铺设。采用焊接方法，焊接强度不得低于母材强度的90%。复合土工膜上的回填土厚度为50厘米，压实要求粘性土的压实度在0.90以上，非粘性土的相对密度在0.60以上。注意膜后回填土不要破坏土工膜的完整性。

土工膜的铺设位置，对于新建的土堤，可以铺设在堤的中间(即心墙)或迎水面(即斜墙)，这两种形式各有特点。心墙布置方式比较省料，但施工时要求堤体填筑与土工膜心墙同时上升，土工膜应做成锯齿形铺设，以适应堤体的沉降，所以施工比较复杂。斜墙布置的优点是堤体填筑完成后才铺膜，施工干扰小，铺膜质量更容易保证。所以国内外新建堤防工程大多采用斜墙结构。但是对于已建堤防的修补和加固工程，由于迎水面有水，为了避免水下施工，所以采用堤内开槽铺膜的方进行施工，建造心墙。当然，如果迎水面没有水，用斜墙形式更方便。